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SELFIE

Optimisation de l’indexation génomique de candidats (calibration de modèles de prédiction et évaluation des valeurs génétiques) à la sélection pour l’efficacité alimentaire en utilisant un lot dérivé phénotypé de bar (Dicentrarchus labrax) pour l’indice de conversion individuel en aquarium, la perte de poids au jeûne, le taux de gras (étendue et localisation des dépôts lipidiques) et les rendements de carcasses

Déroulé du projet : L'Ecloserie Marine de Graveline (EMG) enverra 2000 poissons (bar) de 5g issus des candidats à la sélection à l’Ifremer de Palavas. 800 de ces poissons seront évalués pour leur indice de conversion individuel à un poids moyen de 25g. Une première évaluation en groupe de l’IC des meilleurs et des moins bons poissons en individuel permettra de confirmer la réponse phénotypique corrélée entre IC individuel et IC de groupe. 800 poissons de 150g seront phénotypés pour leur perte de poids au jeûne. Ces 1600 poissons phénotypés et génotypés (puces axiom DLab 57k bar développée par l'Ifremer) seront groupés en 4 catégories en fonction des valeurs génomiques estimées (GEBV) : GEBV_IC+ (ayant une bonne GEBV pour l’IC individuel), GEBV_IC- (mauvaise GEBV pour l’IC individuel), GEBV_J+ (forte GEBV pour la perte de poids au jeûne) et GEBV_J- (faible GEBV pour la perte de poids). Une seconde évaluation de l’IC en groupe des 4 différentes catégories permettra d’établir une relation entre les GEBV des 2 caractères et l’IC de groupe. Après la mesure de l’IC en groupe, les poissons seront abattus, les paramètres de rendement de production seront évalués et une darne servira pour mesurer et localiser le gras par IRM (tâche effectuée par le SYSAAF) ce qui permettra de mieux caractériser les poissons des différents groupes GEBV_IC+, GEBV_IC-, GEBV_J+ et GEBV_J-. Ce protocole nous permettra d’établir quel caractère est plus intéressant à phénotyper et également d’établir des indices composites incluant FCR individuel, perte au jeûne, taux de gras et rendement de carcasse. Un élément indissociable de l'efficacité alimentaire des poisson est leur métabolisme énergétique. Dans ce projet, le métabolisme énergétique individuel de 50 poissons par groupe (GEBV_IC+, GEBV_IC-, GEBV_J+ et GEBV_J-) sera mesuré par analyse de la consommation d'oxygène. Une mesure de métabolisme énergétique en groupes sera faite également au cours des évaluations d'indice de conversion en groupe. Cette tâche sera coordonnée par le CNRS (David McKenzie).

Durée du projet : 2019 - 2022 (36 mois)
Coordination Internationale : François Allal
Zone géographique : 
Financement : FEAMP
Budget global : 485K€
Montant pour Marbec : 118K€
Coordinateur Marbec : François Allal
Partenaires :
CNRS, Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français (SYSAAF), Ecloserie Marine de Gravelines (EMG)
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