Creating a global database of fish functional traits: integrating physiology andecology across aquatic ecosystems
Les traits morphologiques sont-ils représentatifs des traits des poissons (ex. métabolisme,préférence thermique) ? Les stratégie de conservation sont-elles efficaces si elles se concentrent sur quelques traits intégratifs (ex. l'alimentation, la taille), ou cette simplification masque-t-elle la perte de fonctions essentielles (ex. contrôle du réseau trophique, recyclage des nutriments) ? Existe-t-il des « super traits », comme la LMA (surface de photosynthèse par unité de masse sèche des feuilles) chez les plantes, qui capturent une grande quantité d'informations sur l'écologie des poissons ? Existe-t-il des différences fondamentales dans les relations entre les traits des poissons des écosystèmes marins et d'eau douce ?
Aborder ces questions est crucial pour comprendre le rôle joué par les 30 000 espèces de poissons dans les écosystèmes aquatiques et comment les changements globaux affecteront leurs fonctions. Bien que les données sur les traits des poissons (tant au niveau individuel que spécifique) se soient accumulées au cours des dernières décennies, elles demeurent dispersées dans de nombreux ensembles de données se concentrant chacun sur un seul type de traits (morphologie, physiologie, écologie), au sein d'un seul biome (milieux d'eau douce vs milieux marins). Par conséquent, il est complexe de mener des méta-analyses des traits des poissons pour répondre à ces questions clés.
La création de la base de données PHENOFISH vise à pallier à ces limitations : elle résultera de la compilation d'ensembles de données sur les caractéristiques morphologiques, biologiques, comportementales, physiologiques et écologiques des poissons d'eau douce et marins extraites de plus de 10 bases de données mondiales et continentales, et sera la base de données la plus complète sur les traits des poissons à ce jour. La base de données PHENOFISH sera construite sur la base d’un pipeline reproductible pour importer, nettoyer et fusionner les bases de données, dans le but de faciliter son expansion à venir. Elle sera également compatible avec Fishbase, pour suivre les changements taxonomiques. Les mesures des traits seront renseignées au niveau de l'individu (si disponible) et de l'espèce. Le pipeline sera également couplé avec des méthodes d'apprentissage automatique et la phylogénie des espèces afin de prédire le plus de valeurs manquantes possible. PHENOFISH représentera une source d'information essentielle pour les milliers d’écologues des poissons, de biologistes de la conservation et de gestionnaires des écosystèmes aquatiques qui cherchent à prendre en compte les traits phénotypiques pour résoudre les questions écologiques et mieux protéger l’ichtyofaune.
