ATLASea procédera à la collecte, l’identification taxonomique et la préservation permanente d’échantillons biologiques de chaque espèce. A travers deux projets pilotes, l’exploitation de ces données servira des objectifs dans deux domaines : (1) le suivi de la dynamique des écosystèmes marins, en particulier ceux susceptibles d’être perturbés par l’invasion d’espèces exogènes, (2) l’identification de nouvelles fonctions et le bioengineering appliqué à la découverte de nouvelles molécules, métabolites, matériaux et voies de synthèses.
Enfin, ATLASea s’adossera à l’initiative European Reference Genome Atlas (ERGA), Il sera en résonance avec le partenariat européen « Une économie bleue neutre pour le climat, durable et productive » et s’intégrera avec les initiatives « Blue Cloud » de l’Union Européenne et « Decade of the Oceans » des Nations Unies.
ATLASea prévoit de séquencer le génome de 5000 espèces sur les 12000 espèces recensées en ZEE métropolitaine et 1000 espèces en outre-mer, à travers une couverture phylogénétique ciblée selon des critères visant à comprendre et analyser les écosystèmes particulièrement menacés, fragiles, biologiquement importants et économiquement stratégiques