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Thèses

Chargée de mission : Béatrice Bec

L’UMR accorde un budget de 1500 € à chaque doctorant qu’il peut utiliser en toute liberté pour l’aider dans ses activités de thèse (participation à une conférence, visite d’un partenaire scientifique, petits achats, etc.). Des appels annuels sont lancés par la chargée de mission “Formation”, qui gère les enveloppes individuelles sur les 3 ans de chaque thèse.

Par ailleurs, l’UMR offre à l’ensemble des doctorants la possibilité de passer un week-end de retraite pour échanger entre eux sur leur travail et partager des moments conviviaux. Deux représentants des doctorants participent au Conseil d’Unité de l’UMR.

Cléa Abello (française), "Un réseau d'aires marines protégées en Méditerranée pour optimiser les synergies au sein du nexus biodiversité-pêche-climat". Encadrant.e.s : Y. Shin, B. Ernande. Inscription en thèse le 09/01/2022 à l'Université de Montpellier.

Hicham Aboulaala (marocain), "Etude de la biologie et de l'écologie du dinoflagellé neurotoxique gymnodinium catellatum évoluant en Méditerranée Ouest-Marocaine". Encadrants : M. Laabir, B. Rijalleblad (INRH Tanger), M. El Kbiach (Univ A. Saadi, Tetouan, Maroc). Inscription en thèse le 01/10/2022 à l'Université A. Saadi, Tetouan Maroc.

Mohamed Ahmed Sougueh (djiboutien), "Caractérisation de la croissance et de la structure de population de Thazard rayé (Scomberomorus commerson) dans le Nord Ouest de l’Océan Indien et dans la Mer Rouge. Encadrant : D. Kaplan. Inscription en thèse le 11/01/2018 à l'Université de Montpellier.

Manon Airaud (française), "Les Dispositifs de Concentration de Poissons : usages, enjeux et gestion d’une technique de pêche en transformation utilisée au sein de la pêcherie thonière tropicale industrielle". Encadrants : L. Dagorn, B. Moizo. Inscription en thèse le 12/12/2018 à l'Université Paul Valery Montpellier III.

Kátia Cristina Aparecido (brésilienne), "Vulnérabilités de la fonctionnalité et de la diversité des communautés de poissons marins en milieu tropical : une étude de cas du nord-est du Brésil". Encadrants : B. Mérigot, T. Frédou. Inscription en thèse à l'UFRPE (Universidade Federal Rural de Pernambuco) le 31/05/2021.

Erwan Auguin (française), "Rôle des traits de personnalité dans l’hétérogénéité comportementale observée chez les orques et leur influence sur la dynamique de populations impliquées dans des conflits d’usage avec l’Homme". Encadrants : P. Tixier, C. Guinet. Inscription en thèse le 20/06/2022 à l'Université de La Rochelle.

Frédérique Avignon (française), "Mouvements et migrations du thon rouge de l'Atlantique". Encadrants : O. Maury, T. Rouyer. Inscription en thèse le 05/09/2022 à l'Université de Montpellier.

Sophie Benboudjema (française), "Simulation par apprentissage profond du comportement des oiseaux marins : évaluation de l’impact des parcs éoliens en mer". Encadrante : S. Lanco Bertrand. Inscription en thèse le 06/02/2023 à l'Université de Montpellier.

Marine Beneat "Lien entre diversité génétique et fonctionnelle chez les poissons téléostéens marins et implications pour leur résilience face au changement global". Direction de thèse : Y.-J. Shin (IRD) ; co-encadrant : B. Ernande (Ifremer).

Meriem Cyria Bensebaini (française), "Elaboration d'un modèle de complexité intermédiaire pour le Golfe du Lion". Encadrants : J.-M. Fromentin, G. Certain. Inscription en thèse le 01/10/2020 à l'Université de Bretagne Occidentale (UBO).

Gabriel Bittencourt (brésilien), "Spatial patterns of bacterio- and phytoplankton functional diversity under varying hydrographic forcing in the southwestern tropical Atlantic". Encadrants : P. Melo (UFPE Brésil), J C Molinero. Inscription en thèse le 01/01/2020 à l'UFPE (Recife).

Thomas Bockel (française), "AIS, imagerie et big data ; une approche moderne de l’étude et de la gestion des pressions anthropiques et de leurs impacts sur les écosystèmes marins côtiers de Méditerranée française". Encadrants : J. Deter, N. Mouquet. Inscription en thèse le 21/12/2021 à l'Université de Montpellier.

Constance Bourdier "Effets des épisodes extrêmes sur les herbiers de phanérogames marines en milieu méditerranéen stressé". Direction de thèse : R. De Wit  (MARBEC, CNRS) ; co-encadrant : V. Ouisse (MARBEC, Ifremer), L. Soissons (UMR DECOD, INRAE). Inscription à l'Université de Montpellier.

Rémy Canet (français), "Etude du suivi migratoire du thon atlantique". Encadrants : J.-M. Fromentin,
T. Rouyer. Inscription en thèse le 08/11/2021 à l'Université de Montpellier.

Karima Chaira (marocaine), "Etude des kystes des dinoflagellés toxiques dans les sédiments superficiels du littotal Atlantique marocain". Encadrants : M. Laabir, H. Rhinane (Univ Hassan II Casablanca, Maroc). Inscription le 10/09/2019 à l'Université Hassan II Casablanca, Maroc.

Lila Colston-Nepali (anglaise), "Histoire évolutive, convergence et parallélisme génétique dans trois complexes cryptiques d’espèces marines européennes". Direction de thèse : S. Lapègue (Ifremer), co-direction : N. Bierne (ISEM). Inscription en thèse à l'Université de Montpellier.

Damien Crestel (français) "Bases génomiques de l'adaptation à la température chez les populations sauvages de bar (Dicentrarchus labrax)". Direction de thèse : M. Vandeputte (INRAE) ; co-direction : F. Allal (Ifremer).

Laureline Dalaut, "Impact des changements climatiques sur les écosystèmes marins globaux". Encadrants : O. Maury (IRD), M. Lengaigne (IRD), P. Guillotreau (IRD).

Thalles Da Silva Pinto (Brésilien),"Effets des microplastiques environnementaux sur les performances des poissons". Encadrants : M.-L. Bégout, A. C. Luchiari. Inscription en thèse le 01/10/2020 à Federal University of Rio Grande do Norte- Brazil (UFRN, Brésil).

Vincent Danielli (français), "Amélioration et compréhension des projections océaniques physiques et biogéochimiques océaniques dans le Pacifique tropical". Encadrant : M. Lengaigne. Inscription en thèse le 01/10/2021 à l'Université de Montpellier.

Margot Dentan (française), "Co-construire le suivi d’une espèce invasive marine émergente : le cas des réseaux d’observation du crabe bleu dans les lagunes méditerranéennes françaises". Encadrants : R. de Wit (CNRS, MARBEC), P. Gautreau (Sorbonne Université, PRODIG). Inscription en thèse à l'Université Paris 1 Panthéon-Sorbonne.

Maia Douillet (française) "Modélisation des pêcheries et des marchés halieutiques mondiaux. Scénarios d’évolution à l’horizon 2100 : gouvernance, équité Nord-Sud et justice climatique". Direction de thèse : O. Maury (IRD), co-encadrant : P. Guillotreau (IRD).


Anaëlle Durfort "Le rôle des grands vertébrés marins dans la productivité et la séquestration de carbone des écosystèmes". Direction de thèse : M. Troussellier (CNRS) ; co-encadrant : D. Mouillot (UM).

Paul Estoup, "Contribution de la composante virale et microbienne dans le fonctionnement de l’holobionte Ulve (« laitue de mer »)". Direction : G. Blanc (MIO) et A. Gobet (Ifremer). Inscription à l'Université d'Aix-Marseille.

Ulysse Flandrin (français), "Contributions des récifs coralliens aux populations locales : rôles des aires marines protégées" . Encadrants : D. Mouillot, N. Mouquet. Inscription en thèse à l'Université de Montpellier depuis le 01/09/2022.

Valentine Fleure (française), "Coupler surveillance vidéo et intelligence artificielle pour recenser et mieux protéger la mégafaune marine : le cas du lagon de Mayotte". Encadrants : S. Villéger. Inscription en thèse à l'Université de Montpellier depuis le 01/06/2022.

Antoine Gradel (français), "Structure génétique, connectivité et adaptation des huîtres perlières du genre Pinctada au changement global dans l’Océan Pacifique". Encadrants : . Inscription en thèse le 04 Octobre 2021 à l'ED EPHE à L'Université PSL (Paris Sciences & Lettres).

Amanda Graziele Araujo (brésilienne), "Aspects de la dynamique des populations et de l'utilisation de l'habitat déduits des otolithes de Scomberomorus brasiliensis (Perciformes:Scombridae) sur la côte nord-est du Brésil". Encadrant.e.s : F. Duponchelle, R. Lessa. Inscription en thèse le 01/03/2020 à l'UFPE (Recife).

Johann Ludovic Martial HAPPI (gabonais), "La macrofaune benthique des mangroves gabonaises : impact des activités humaines et bioindication des pressions de pollution". Co-encadrement : Prof. Patrick Mickala USTM et Dr. Christophe Leboulanger IRD ; collaboration LEMAR Dr. Gauthier Schaal et USTM Dr. Aimé-Roger Nzigou. Inscription en thèse en 2021 à l'Université des Sciences et Techniques de Masuku, Franceville.

Cyril Hautecoeur "Des scénarios pour prédire le futur des stocks de poissons dans les récifs coralliens en termes de biomasse, à l'échelle globale, dans un contexte de changement climatique". Direction de thèse : D. Mouillot (UM) ; co-encadrant : C. Mellin (University of Adelaide).

Ignatius Hargiyatno (indonésien), "Les DCPs en Indonésie : usages et impacts ". Encadrant.e.s : L. Dagorn, W. Wudianto, M. Capello. Inscription en thèse le 01/01/2023 à l'Université de Montpellier.

Stéphanie Hopkins (américaine), "Medisis : Impacts combinés de la stucturation spatiale de la population de merlu, de l'environnement et de la pêche sur la pêcherie de merlu du Golfe du Lion : une approche par inférence statistique et simulation pour l'évaluation du plan de gestion Med". Encadrante : S.Vaz. Inscription en thèse le 15/10/2020 à l'Université de Montpellier.

Mustapha Ibghi (marocain), "Etudes des dinoflagellés benthiques toxiques dans les eaux Méditerranéennes du Maroc". Encadrants : M. Laabir, B. Rijalleblad (INRH Tanger), M. El Kbiach (Univ A. Saadi, Tetouan, Maroc). Inscription en thèse le 01/10/2018 à l'Université A. Saadi, Tetouan Maroc.

Hans Jara (péruvien), "Détection et  variabilité spatio-temporelle des groupes fonctionnels phytoplanctoniques dans le système  d’upwelling du Pérou". Encadrants :  C. Colas, H. Demarcq (au Pérou : pour l’IMARPE, M. Jorge Tam, Arturo Aguirre). Inscription en thèse le 14/01/2022 à Sorbonne Université (ED "Sciences de l'environnement d'Île de France").

Pieter-Jan Keleman, "Ethnobiology of mangrove aquatic biodiversity and its uses in agricultural
settings of Guinea-Bissau". Co-direction de thèse : J. Panfili (IRD), R. Sá (ISCSP : Instituto Superior de Ciências Socias e Politicas), M. Temudo (ISA : Instituto Superior de Agronomia) de l'Université de Lisbonne, M.-C. Cormier-Salem (IRD UMR PALOC) ; encadrant : J.-D. Durand (IRD). Inscription en thèse le 01/09/2021 à l'Université de Lisbonne au Portugal.

Thomas Kremer (français), "Le plastique comme vecteur de bactéries potentiellement pathogènes vers la bidiversité exploitée". Encadrants : T. Bouvier, I. Paul-Pont (UMR LEMAR). Inscription en thèse le 01/02/2023 à l'Université de Montpellier.

Emmanuel N'guessan KOUAME (ivoirien), "Ré-évaluation taxonomique de la diversité des poissons marins de Côte d’Ivoire par l’approche de barcoding ADN". Encadrant.e.s : B. Abouo Adepo Gourene, J.-D. Durand. Inscription en thèse le 01/07/2022 à l'École Doctorale Sciences, Technologies et Environnement (ED-STE) en Côte d’Ivoire.

Vuyokazi KUTU (sud-africaine), "Effect of Ulva supplemented feeds, with and without probiotic (Debaryomyces hansenii) supplementation, on the growth, immunity, oxidative stress response and gut morphology/microbiome of the (dusky kob) Argyrosomus japonicus". Encadrant.e.s : B. Macey (DFFE), M. Darias (IRD), V. Coyne (UCT), K. Christison (DFFE). Inscription en thèse le 01/01/2023 à l'Université du Cap en Afrique du Sud.

Sadhvi KWATRA (indienne), "Response of Arabian sea primary productivity to climate variability and change". Encadrant : M. Lengaigne. Inscription en thèse le 04/10/2021.

Pierre Labourgade (français), "Évaluation de l’utilisation de l’habitat et de la connectivité des
peuplements de poissons à de multiples échelles spatiales et implications pour le développement des parcs éoliens offshores (projet FISHOWF). Encadrants : É. Feunteun et T. Trancart (MNHN), L. Couturier (FEM), J. Bourjea et M. Woillez (Ifremer), J. Reubens (VLIZ). Inscription en thèse le 14/10/2021 à Sorbonne Université - Paris 1.

Wencheng Lau Medrano (Péruvien), "DYNamique spatio-temporelle de l’Abondance des Stocks de Thons tropicaux et de la stratégie d’effort de pêche à la senne par Intelligence Artificielle (DYNASTIA)". Encadrements : D. Kaplan, D. Gaertner, et F. Marsac (IRD), L. Guéry (UMR PHIM, CIRAD). Inscription en thèse le 17/12/2021 à l'IMARPE et Universidad Peruana Cayetano Heredia.

Sunhee Lee (Coréenne), "Biogéographie et dynamique des méduses dans les eaux côtières internationales". Encadrants : J.-C. Molinero, Jiang-Shiou Hwang. Inscription en thèse le 14/02/2019 à l'Université NTOU National Taïwan Ocean University (Keelung city).

Loïc Lehnhoff (français), "Etho-acoustique et Intelligence Artificielle : application à la protection des cétacés". Encadrants : B. Mérigot, H. Glotin. Inscription en thèse le 01/10/2021 à l'Université de Montpellier.

Nicolas MARTIN "Étude du phénotype de tolérance aux stress multiples d'une espèce invasive de poisson, la gambusie (Gambusia holbrooki), et de ses conséquences sur les écosystèmes aquatiques". Direction de thèse : É. Farcy (UM) ; co-encadrant : L. Jacquin (EDB, CNRS), S. Blanchet (SETE, CNRS).

Reginah MDHLUVU (sud-africaine), "Use of alternative ingredients for the development of sustainable diets for farmed dusky kob Argyrosomus japonicus (Temminck & Schlegel 1843) juveniles". Encadrants : M. Darias (IRD), H. Kaiser (Rhodes University). Inscription en thèse le 01/01/2022 à Rhodes University.

Jade MILLOT " Conservation et planification spatiale des écosystèmes marins vulnérables en Méditerranée". Direction de thèse : S. VAZ (Ifremer) et co-encadrement : Valentina Lauria (CNR, Italie).

Sophie MORISSEAU (française), "Dynamique des plages et stratégie de ponte des tortues vertes (Chelonia mydas) dans un contexte d'une rapide élévation du niveau marin relatif, Mayotte". Encadrants : E. Sucré, D. Chevallier (BOREA) ; Co-encadrant : M. Jeanson (EspasDev). Inscription en thèse le 01/10/2020 à l'Université de Montpellier.

Jeanne Naudet (française), "Plastiques en aquaculture : conséquences sur la santé animale et la sécurité alimentaire", jusqu'au 31 août 2024 à Montpellier. Encadrants : E. Roque d'Orbcastel,
J.-C. Auguet. Inscription en thèse à l'Université de Montpellier et à l'Ecole Nationale Supérieure de Lyon depuis le 01/09/2021.

Théo NAVARRO (français), "La robustesse physiologique et comportementale des populations de bar, Dicentrarchus labrax en fonction de la température et face à des épisodes climatiques extrêmes". Encadrant.e.s : D. Mckenzie, X. Cousin et I. Leguen. Inscription en thèse le 01/10/2022 à l'Université de Montpellier.

Yannick Nkouefuth Nfongmo (camerounais), "Introduction des espèces phytoplanctoniques non indigènes dans l’estuaire du Wouri (Douala, Cameroun) via les réservoirs de ballast des navires faisant escale au Port Autonome de Doula : cas des Dinoflagellés toxiques". Encadrants : Pr Thomas Efole Ewoukem, Dr Onana Fils Mamert, E. Masseret. Inscription en thèse le 04/02/2021 à l'Université de Douala au Cameroun.

Rafaela PASSARONE (brésilienne), "Effets des impacts anthropiques sur un écosystème marin et ses conséquences sur la viabilité économique de la pêche crevettière des régions Nord et Nordeste du Brésil". Encadrant.e.s : F. Lucena Fredou (UFRPE), P. Guillotreau. Inscription en thèse le 01/11/2021 à l'UFRPE à Recife, Brésil.

Hung Manh Pham (Vietnamien), "Diversité larvaire, distribution et connectivité des habitats côtiers dans l’aire marine protégée de Con Dao au Vietnam". Co-Direction : J.-D. Durand, HUY. Co-encadrant : J. Panfili. Inscription en thèse le 01/04/2016 à University of Science VNUHCM Ho Chi Minh City.

Franck Pichot (français), "Techniques innovantes et complémentaires pour caractériser la biodiversité à l’échelle de la mégafaune". Encadrants : J. Deter, O. Adam. Inscription en thèse à l'Université de Montpellier.

Ignacio Pita Vaca , "Évaluation de la vulnérabilité climatique des ressources halieutiques et des pêcheries méditerranéennes". Direction : Y. Shin, D. Mouillot. Inscription en thèse à l'Université de Montpellier.

Kevin PLANOLLES (français), "Recensements automatisés de la biodiversité des poissons côtiers". Encadrant : S. Villéger. Inscription en thèse le 15/09/2022 à l'Université de Montpellier.

Teresa Popp (américaine), "Shifts in allele frequencies and their association to fitness and in situ expression in the invasive copepod Eurytemora affinis complex". Encadrante : C. Lorin-Nebel, Lee. Inscription en thèse le 01/09/2020 à l'Université de Montpellier.

Antoine Ricouard (français), "Multitout Concilier des objectifs de rendements durables des pêches avec des objectifs écosystémiques : points de référence multi-spécifiques de gestion des pêches et méthodes d’évaluation de scénarios de gestion multi-objectifs". Encadrantes : S. Mahévas, S. Lehuta. Inscription en thèse le 01/10/2020 à Agrocampus Ouest.

Jérôme Roux (français), "Modèles de comportements collectifs des bateaux de pêche et dynamique des flottilles au service de la gestion des pêches". Encadrants : S. Mahevas, J. Lebranchu, N. Bez. Inscription en thèse le 01/10/2019 à l'Université de Nantes.

Eliot RUIZ "Rôle de la dispersion larvaire pour mieux appréhender les conséquences du changement climatique sur la biodiversité des poissons coralliens". Direction de thèse : J. Panfili (IRD). Inscription en thèse le 01/10/2022 à l'Université de Montpellier.

Ouafa SADLAIB (algérienne), "Etude des dinoflagellés benthiques potentiellement toxiques du golf d'Annaba, Algérie". Encadrants : M. Laabir, H. Frihi (Univ B. Mokhtar, Annaba, Algérie). Inscription en thèse le 01/10/2022 à l'Université Badji Mokhtar Annaba, Algérie.

Loïc Sanchez , "ADN environnemental et prédiction des changements de répartitions des poissons marins dans un contexte de changement climatique". Encadrement : F. Leprieur (UM) et S. Manel (CEFE, EPHP PSL) ; co-encadrant N. Loiseau (CNRS). Inscription en thèse le 01/10/2021 à l'Université de Montpellier.

Yago Bruno SILVEIRA NUNES (brésilien), "Structure and dynamics of pelagic copepods from the Amazon Continental Shelf. From patterns to processes". Encadrants : P. Melo (UFPE), X. Garcia (UFRA), JC Molinero. Inscription en thèse le 01/01/2023 à l'UFPE.

Rayssa SIQUEIRA (Brésilienne), "Estratégias de história de vida de peixes mesopelágicos em um contexto de pressões globais crescentes". Encadrant.e.s : J. Panfili, F. Duponchelle, L. Fredou.
Inscription en thèse le 01/01/2022 à Universidade Federal Rural de Pernambuco (UFRPE) Recife, Brésil.


Paul Bertrand Sob Nangou (camerounais), "Dynamique de la physicochimie et structure du zooplancton des zones côtières et océaniques du Cameroun (Golfe de Guinée Camerounais)". Encadrants : J.-C. Molinero, S. Zebaze Togouet (Univ. Yaoundé). Inscription en thèse le 01/03/2019 à l'Université de Yaoundé 1 - Cameroun.


Ngan Trong Tran (vietnamien), "Salinity impact on catfishes and their aquaculture in the Mekong Delta". Encadrants : J. Panfili, D. H. Hoang, M. Cormier-Salem. Inscription en thèse le 01/02/2016 à l'Université nationale de Hô-Chi-Minh-Ville (VNUHCM).

Anissa VOLANANDIANA (malgache), "Analyse de la diversité ichtyologique de la baie de Ranobe au sud ouest de Madagascar, de son exploitation et de sa perception par les communautés locales". Direction : JD Durand, co-direction : D Rabinary, co-encadrants : T. Lamy, G. Stoica. Inscription en thèse le 01/09/2022 à l'Université de Toliara, Madagascar.

2023

  • Gaël Mariani, "Rôle de la macrofaune marine dans le cycle du carbone, impacts anthropiques et potentielle inclusion dans le portefeuille des Solutions Naturelles pour le Climat". Directeur de thèse : M. Troussellier. Université de Montpellier.

  • Anais Beauvieux, "Impact du changement global sur la physiologie des organismes : une approche protéomique". Directeurs de thèse : J.-M. Fromentin et Fabrice Bertile (CNRS). Université de Montpellier.

  • Agnès Duhamet, "De l’ADN environnemental jusqu’aux plans de conservation pour les poissons côtiers méditerranéens". Directeur·rice·s de thèse : D. Mouillot (UM) et S. Manel (CNRS, UMR CEFE). Université de Montpellier.

  • Cyrille Przybyla, "Une aquaculture durable en milieu contraint, contrôlé et extrême". Directeur de thèse R. Gozlan (IRD). Université de Montpellier.
  • Witold Podlejski, « Détection et modélisation des algues Sargasses de l'océan Atlantique tropical nord ». Directeurs de thèse : C. Lett et L. Berline (MIO). Université d'Aix-Marseille.

  • Aurélien Bouquet, « Étude du dinoflagellé benthique toxique Vulcanodinium rugosum dans les lagunes méditerranéennes soumises au changement global : caractérisation toxinique et dynamique in situ, transfert des toxines dans les maillons trophiques supérieurs et risques associés ». Directeur de thèse : M. Laabir, co-encadrants : E. Abadie et N. Chomérat. Université de Montpellier.

  • Amaël Dupaix, "Impacts of pelagic habitat modifications on the behavior and physiological condition of tropical tuna". Directeurs de thèse : L. Dagorn et J.-L. Deneubourg. Encadrante : M. Capello. Université de Montpellier.

  • Julie Le Ray, "Analyse des facteurs et des conséquences de l'anoxie et des mortalités d'huîtres sur le fonctionnement de la lagune de Thau". Directrice de thèse : A. Fiandrino. Encadrantes : M. Richard et B. Bec. Université de Montpellier.

  • Antonio Garcia Quintas "Breeding ecology and conservation of Cuban larids (gulls and terns) in an anthropogenic context". Encadrants : S. Lanco Bertrand, C. Barbraud (CNRS), D. Avila (Univ. de la Havane). Université de Montpellier.

  • Camille Magneville "Importance de la diversité fonctionnelle en poissons et de sa variabilité temporelle pour le fonctionnement des écosystèmes marins côtiers". Encadrants : S. Villéger, T. Claverie. Université de Montpellier.

  • Laëtitia Mathon "L'ADN environnemental pour décrire les patrons de diversité des poissons à large échelle et informer la conservation". Encadrants : S. Manel, D. Mouillot, L. Vigliola. Université de Montpellier.

  • Dedah Ahmed Babou, "Modèles spatio-temporels opérationnels pour le suivi, la gestion adaptative et la durabilité de l'exploitation des ressources marines : cas du poulpe en Mauritanie". Encadrants : Nicolas Bez. Université de Montpellier.

2022

  • Alaia Morell "Dynamiques éco-évolutives des espèces exploitées en Mer du Nord en réponse à des variations biotiques et abiotiques de l'environnement". Encadrants : Y. Shin, P. Marchal, B. Ernande. Université de Boulogne-sur-mer.

  • Adrien Brunel "Aide à la décision pour la planification spatiale marine : l’optimisation en nombres entiers au service de la conception des aires marines protégées". Directeur·rices de thèse : S. Bertrand, S. Thorin. Université de Montpellier.

  • Harilanto Felana Andrianjakarivony "Caractérisation du virome d’un écosystème tropical fortement anthropisé : la Lagune Ebrié, en Côte d’Ivoire". Encadrants : C. Denues, Y. Bettarel. Université d'Aix/Marseille.

  • Amédée Roy, "Intelligence artificielle appliquée à l'écologie des oiseaux marins (sulidés) : modélisation des stratégies de recherche alimentaire dans des écosystèmes tropicaux riches et pauvres". Encadrants : S. Bertrand, R. Fablet (Télécom Bretagne). Université de Montpellier.

  • Julie Salvetat, "Impact de la structuration physico-chimique sur la distribution des poissons pélagiques et démersaux du NE du Brésil évalué par acoustique active multifréquence". Encadrants : N. Bez, A. Bertrand, D. Nerini (Univ de Luminy Marseille). Université Federale Rurale de Pernambuco (UFRPE) et Université de Montpellier.

  • Florian Baletaud, "Ingénierie récifale sous-marine : recensement de la biodiversité par intelligence artificielle et ADN environnemental". Encadrants : D. Mouillot, L. Vigliola. Université deMontpellier.

  • Valentina Leoni Silva "Ecology of Rhizostoma pulmo in the southern European seas: from biogeography to population dynamics". Encadrants : J.-C. Molinero, D. Bonnet, Université de Montpellier.
  • Quanquan Cao, "Réponses physiologiques du loup Dicentrarchus labrax en milieu hypersalé dans un contexte de changements climatiques". Encadrante : C. Lorin-Nebel, Université de Montpellier.

  • Criscely Lujan, "Scenarios of climate change and fishing management in the Humboldt marine ecosystem :dealing with uncertainty and assessing robustness in biodversity projections". Encadrante : Y. Shin, Université de Montpellier.

  • Ahmed Riyaz Jauharee, "The tuna pole and line FAD (Fish Aggregating Device) fishery of the Maldives: towards science-based management through fishers and scientific knowledge". Directeur de thèse : L. Dagorn, encadrants : S. Adam, M. Capello, F. Forget .

  • Laura Mégevand, "Traits écophysiologiques et comportementaux de trois espèces de crabes soumis à différents niveaux de stress anthropique dans les mangroves insulaires du Canal du Mozambique".
    Encadrants : J.-H. Lignot, E. Sucré, Université de Montpellier.

  • Romaissa Harid, "Étude par télédétection et mesures in situ des efflorescences algales et de la matière en suspension dans le Bassin Algérien". Encadrants : F. Houma-Bachari, H. Demarcq, Ecole Nationale Supérieure des Sciences de la mer et de l'aménagement du littoral (ENSSMAL), Alger.

2021

  • Thibault Cariou, "Dynamiques spatiales et temporelles des communautés halieutiques en milieu estuarien : apport de la géostatistique à la compréhension d'une nourricerie de poissons plats en baie de Seine". Encadrants : N. Bez, Laurent Dubroca, C. Vogel, Université de Montpellier.

  • Taha Imzilen, "Analyse et modélisation des trajectoires des dispositifs à concentration de poissons dérivants (DCP) dans les zones océaniques tropicales et estimation des risques associés à leur déploiement". Encadrants : C. Lett, D. Kaplan, Université Campus Pierre et Marie Curie.

  • Marie-Charlotte Cheutin, "Biodiversité et rôle des microbiomes entériques des poissons dans les écosystèmes coralliens". Encadrants : T. Bouvier, J.-C. Auguet, S. Villéger, Université de Montpellier.

  • Elsa Gadoin, "Écologie et génomique du microbiome des thons tropicaux". Encadrants : Y. Bettarel, C. Desnues (MIO), T. Bouvier, J.-C. Auguet, Université de Montpellier.

  • Tanguy Soulié, "Réponses métaboliques des communautés planctoniques marines aux perturbations : apport des mesures à haute-fréquence acquises dans les mésocosmes in situ".
    Encadrant : B. Mostajir, Université de Montpellier.

  • Alexandre Mignucci, "Rôle de l'environnement dans la dynamique spatiale des poissons marins à l'interface lagune-mer en Méditerranée française : approches d'écologie spatiale et d'écophysiologie appliquées à trois espèces côtières". Encadrants D. McKenzie, J. Bourjea, Université de Montpellier.

  • Émilie Boulanger, "Informer la conservation de la biodiversité marine grâce au séquençage nouvelle génération : des gènes aux communautés". Encadrants : D. Mouillot, S. Manel, Université de Montpellier.

  • Yago Ya Hilaire Amemou, "Modélisation biophysique de la dispersion et de la croissance des larves de sardinelles dans le Golfe de Guinée". Encadrants : C. Lett, A. Aman, V. Koné, Université Félix Houphouët Boigny à Abidjan Côte d’Ivoire.

  • Júlio Guazzelli Gonzalez, "Estuaries as nursery habitats for the horse-eye jack (Caranx latus) in North-Eastern Brazil". Encadrants : A. Darnaude, T. Frédou, Duarte, Université Fédérale Rurale du Pernambuco, Recife, Brésil.

  • Sosthène Akia, "Du global au local : étude des interactions entre les thons de la ZEE de la Côte d’Ivoire et le reste du stock de l’Atlantique-Est à partir des données du programme de marquage AOTTP de l’ICCAT et de quelques indicateurs biologiques". Encadrants : D. Gaertner, J. M. Amandé, Université de Montpellier.

  • Nina M. D. Schiettekatte, "Fish-mediated functions on coral reefs". Encadrants : Valeriano Parravicini, Sébastien Villéger, Université de Perpignan (UPVD) et CRIOBE.

  • Ramilla V. Assunção, "Thermohaline stratification in the southwestern tropical Atlantic: from physical processes to acoustic ecology". Encadrants : Alex Silva, Anne Lebourges-Dhaussy, Arnaud Bertrand, Université de Bretagne Occidentale (UBO) et Université Fédérale de Pernambuco (UFPE), Brésil.

  • Alina Nathanaël Dossa, "Near-surface Ocean dynamic off northeast Brazil and coastal sea surface salinity gradients in the world ocean". Encadrant : A. Bertrand, Université Fédérale de Pernambuco (UFPE), Recife, Brésil.

  • Ronan Griot, "Développement d’outils et de méthodes de sélection génomique chez le bar et la daurade". Encadrants : M. Vandeputte, F. Allal, S. Brard Fudulea, Université AgroParisTech Paris.

  • Leandro Nolé Eduardo, "Lighting up the dark side of the ocean : biodiversity and ecology of deep-sea fishes from the Southwestern Tropical Atlantic". Encadrants : A. Bertrand, F. Lucena Fredou, UM et UFRPE Université Fédérale Rurale de Pernambuco (Brésil) co-tutelle.

  • Géraldine Perez, "Effets du nombre d’objets flottants sur le comportement des thons tropicaux". Encadrants : D. Gaertner, J.-L. Deneubourg, M. Capello, Université de Montpellier.


2020

  • Yannick Baidai, "Dérivation d’un indice direct d’abondance pour les thons tropicaux basé sur leur comportement associatif avec les objets flottants". Encadrants : M. Capello, L. Dagorn, Université de Montpellier.

  • Miriam Brandt, "Metabarcoding in the abyss : uncovering deep-sea biodiversity through environmental DNA". Encadrants : S. Arnaud-Haond, D. Zeppilli, Université de Montpellier.

  • Justine Courboulès, "Effets du réchauffement sur la croissance et la mortalité par prédation des communautés phytoplanctoniques et bactériennes en zone côtière méditerranéenne : approche expérimentale en mésocosmes in situ et étude combinée avec l’acidification". Encadrants : B. Mostajir, Université de Montpellier.

  • Valérie Derolez, "Approche dynamique et intégrée de l’évaluation d’un socio-écosystème côtier. Application à la lagune de Thau, son état écologique et ses bouquets de services écosystémiques sur la période 1970-2018". Directrice de thèse : C. Aliaume (UM), co-encadrants : N. Malet (Ifremer), R. Mongruel (Ifremer), Université de Montpellier.

  • Guillaume Feuilloley, "Analyse de la variabilité spatio-temporelle du zooplancton en Méditerranée nord-occidentale et conséquences sur les populations de petits pélagiques". Encadrants : J.-M. Fromentin, C. Saraux, Université de Montpellier.

  • Fabrice Houngnandan, "Impact des pressions anthropiques et de l’environnement sur les herbiers de posidonia oceanica en Méditerranée française", directrice de thèse : J. Deter (UM), Université de Montpellier.

  • Cyrielle Jac, "Intégrité des habitats benthiques du plateau continental face aux perturbations physiques naturelles et aux arts traînants : quelles méthodes d’observations ? Comment suivre le retour vers le Bon État Écologique ?". Encadrants : S. Vaz, N. Desroy, D. Mouillot, Université de Montpellier.

  • Emna Krichen, "Optimisation et prédiction de la production algale en polycultures : approches expérimentales et modélisation mathématique". Encadrants : E. Fouilland, E. Rapaport (INRA), Université de Montpellier.

  • Virginie Marques, "Nécessité, potentiel et limitations de l’approche en unités taxonomiques moléculaires pour analyser la biodiversité de l’ADN environnemental des poissons", directeur de thèse : D. Mouillot, Université de Montpellier.

  • Guilhem Marre, "Développement de la photogrammétrie et d’analyses d’images pour l’étude et le suivi d’habitats marins", direction  de thèse: J. Deter (UM), S. Luque (INRAe), Université de Montpellier.

  • Charles Rodde, "L’efficacité alimentaire individuelle chez le poisson : méthodes de mesure directe et prédicteurs indirects pour développer des programmes de sélection génétique chez deux espèces aquacoles majeures, le bar européen Dicentrarchus labrax et le tilapia du Nil Oreochromis niloticus". Direction de thèse : B. Chatain, H. de Verdal, Université de Montpellier.

  • Lucie Sidan, "Le droit public face à la « capacité de charge ». L’administration des espaces de la zone côtière". Directrive de thèse : F. Galletti, Université de Perpignan Via Domitia (UPVD).

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