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Thèses

Chargée de mission : Béatrice Bec

L’UMR accorde un budget de 1500 € à chaque doctorant qu’il peut utiliser en toute liberté pour l’aider dans ses activités de thèse (participation à une conférence, visite d’un partenaire scientifique, petits achats, etc.). Des appels annuels sont lancés par la chargée de mission “Formation”, qui gère les enveloppes individuelles sur les 3 ans de chaque thèse.

Par ailleurs, l’UMR offre à l’ensemble de doctorants la possibilité de passer un week-end de retraite pour échanger entre eux sur leur travail et partager des moments conviviaux. Deux représentants des doctorants participent au Conseil d’Unité de l’UMR.

Dedah Ahmed Babou (mauritanien), "Modèles spatio-temporels opérationnels pour le suivi, la gestion adaptative et la durabilité de l'exploitation des ressources marines : cas du poulpe en Mauritanie". Encadrants : Nicolas Bez, Cheikh Baye. Inscription en thèse le 01/02/2020 à l'Université de Montpellier.

Manon Airaud (française), "Les Dispositifs de Concentration de Poissons : usages, enjeux et gestion d’une technique de pêche en transformation utilisée au sein de la pêcherie thonière tropicale industrielle. Encadrants : L. Dagorn, B. Moizo. Inscription en thèse le 12/12/2018 à l'Université Paul Valery Montpellier III.


Felana Andrianjakarivony (malgache), "Ecogénomique des virus pathogenes humains dans deux sites côtiers anthropisés en Côte d'Ivoire et au Vietnam". Encadrants : C. Denues, Y. Bettarel. Inscription en thèse à l'Université d'Aix/Marseille le 01/11/2018.

Florian Baletaud (français), "Ingénierie récifale sous-marine : recensement de la biodiversité par intelligence artificielle et ADN environnemental". Encadrants : D. Mouillot, L. Vigliola. Inscription en thèse à l'Université deMontpellier le 15/04/2019.

Anais Beauvieux (française), "Impacts des contaminants inorganiques sur l’état physiologique des populations de poissons du Golf du Lion : une approche mécanistique sur deux espèces modèles : la Sardine (Sardine pilchardus) et la Daurade royale (Sparus aurata)". Encadrant : J.-M. Fromentin. Inscription en thèse le 01/10/2020 à l'Université de Montpellier.

Meriem Cyria Bensebaini (française), "Elaboration d'un modèle de complexité intermédiaire pour le Golfe du Lion". Encadrants : J.-M. Fromentin, G. Certain. Inscription en thèse le 01/10/2020 à l'Université de Bretagne Occidentale (UBO).

Quanquan Cao (chinois), "Réponses physiologiques du loup Dicentrarchus labrax en milieu hypersalé dans un contexte de changements climatiques". Encadrante : C. Lorin-Nebel. Inscription en thèse le 01/10/2018 à l'Université de Montpellier.

Susana Cardenas Alayza (péruvienne), "Mécanismes de coexistence de 2 espèces sympatriques d'otaridés, Arctocephalus australis et Otaria byronia à Punta San Juan, Pérou". Directeurs de thèse : Y. Tremblay, D. Gutierrez UPCH. Inscription en thèse le 01/04/2018 à l'Université péruvienne Cayetano Heredia à Lima, et à l'Université de Montpellier.

Thibault Cariou (français), "Des nourriceries de la baie de Seine aux populations exploitées : approche empirique". Encadrants : N. Bez, Laurent Dubroca, C. Vogel. Inscription en thèse le 25/04/2019 l'Université de Montpellier.

Marie-Charlotte Cheutin (française), "Biodiversité et rôle des microbiomes de poissons dans les écosystèmes récifaux". Encadrants : T. Bouvier, J.-C. Auguet, S. Villéger. Inscription en thèse le 01/10/2018 à l'Université de Montpellier.

Alexandra Diallo (française), "Innovations pour la conservation des requins soyeux". Encadrants : L. Dagorn, M. Capello. Inscription en thèse le 01/12/2019 à l'Université de Montpellier.

Amaël Dupaix (français), "Les objets flottants d'origine artificielle : piège ou facilitateur écologique pour les espèces marines associées". Directeurs de thèse : L. Dagorn, J.-L. Deneubourg. Encadrante : M. Capello. Inscription en thèse le 01/09/2020 à L'Université de Montpellier.

Virginie Dupré (française), "Modèlisation des communautés marines pélagiques, démersales et benthiques de l'Atlantique Nord Est avec le modèle APECOSM. Impacts des changements climatiques et scenarios d'évolution de leur exploitation". Encadrant : O. Maury. Inscription à l'Université de Montpellier.

Elsa Gadoin (française), "Ecologie et génomique du microbiome des thonidés". Encadrants : Y. Bettarel, C. Desnues (MIO), T. Bouvier, J.-C. Auguet. Inscription en thèse le 05/10/2018 à l'Université de Montpellier.

Antonio Garcia Quintas (cubain), "Distribution, écologie et dynamique des oiseaux marins des cayes du nord de Cuba, effets des pressions anthropiques". Encadrants : S. Bertrand, C. Barbraud (CNRS), E. Cam (UBO), D. Avila (Univ. de la Havane). Inscription en thèse le 01/02/2020 à l'Université de La Havane à Cuba et à l'Université de Montpellier.

Julio Guazzelli-Gonzales (brésilien), "Les estuaires en tant que zones de nourriceries pour le horse-eye jack (Caranx latus) au nord-est du Brésil". Encadrants : A. Darnaude, Frédou, Duarte. Inscription en thèse le 23/05/2017 à l'Université de Pernambuco.


Johann Ludovic Martial HAPPI (gabonais), "La macrofaune benthique des mangroves gabonaises : impact des activités humaines et bioindication des pressions de pollution". Co-encadrement : Prof. Patrick Mickala USTM et Dr. Christophe Leboulanger IRD ; collaboration LEMAR Dr. Gauthier Schaal et USTM Dr. Aimé-Roger Nzigou. Inscription en thèse en 2021 à l'Université des Sciences et Techniques de Masuku, Franceville.


Florian Hoarau (français), "Traits d'histoire de vie, sélection d'habitats et intéractions trophiques chez les requins-tigre et bouledogue dans les écosystèmes côtiers de la Réunion : contribution à la gestion du conflit homme-requin". Encadrants : S. Jaquemet, A. Darnaude. Inscription en thèse le 19/12/2018 à l'Université de La Réunion.

Stéphanie Hopkins (américaine), "Medisis : Impacts combinés de la stucturation spatiale de la population de merlu, de l'environnement et de la pêche sur la pêcherie de merlu du Golfe du Lion : une approche par inférence statistique et simulation pour l'évaluation du plan de gestion Med". Encadrante : S.Vaz. Inscription en thèse le 15/10/2020 à l'Université de Montpellier.


Taha Imzilen (Marocain), "L’analyse et la modélisation des trajectoires des dispositifs à concentration de poissons dérivants (DCP) et de l’estimation des risques associés à leur échouage". Encadrants : C. Lett, D. Kaplan. Inscription en thèse le 01/10/2018 à Sorbonne Université Campus Pierre et Marie Curie.

Marie Iotti (française), "Le rôle de nurserie des lagunes littorales pour les poissons méditerranéens : vers un potentiel renforcement par la culture d’algues marines.". Encadrants : A. Darnaude, V. Ouisse. Inscription en thèse le 01/09/2018 à l'Université de Montpellier.

Sunhee Lee (Coréenne), "Biogéographie et dynamique des méduses dans les eaux côtières internationales". Encadrants : J.-C. Molinero, Jiang-Shiou Hwang. Inscription en thèse le 14/02/2019 à l'Université NTOU National Taïwan Ocean University (Keelung city).

Valentina Leoni (uruguayenne), "Dynamique de Rhizostoma pulmo (méduse) dans des lagunes côtières méditerranéennes : approche multi-échelles". Encadrants : J.-C. Molinero, D. Bonnet. Inscription en thèse le 24/10/2018 à l'Université de Montpellier.

Camille Magneville (française), "mportance de la diversité fonctionnelle des poissons pour le fonctionnement des écosystèmes marins côtiers". Encadrants : S. Villéger, T. Claverie. Inscription en thèse le 16/09/2019 à l'Université de Montpellier.

Côme Marchais (français), "Réponses des réseaux microbiens marins aux apports de matière organique dissoute terrigène (phénomène de brunissement)". Encadrant : B. Mostajir. Inscription en thèse le 21/09/2020 à l'Université de Montpellier.

Gaël Mariani (français), "Les poissons de haute mer comme pièges à carbone : une solution négligée pour le climat". Encadrant : D. Mouillot. Inscription en thèse le 01/10/2019 à l'Université de Montpellier.

Julia Mcdowell (américaine), "Future of coral reefs in the anthropocene". Encadrants : D. Mouillot. Inscription en thèse le 26/10/2018 à l'Université de Montpellier.

Laura Megevand (française), "Indicateurs biologiques de l'état de santé des mangroves dans le canal du Mozambique". Encadrants : J.-H. Lignot, E. Sucre. Inscription en thèse le 30/09/2018 à l'Université de Montpellier.

Alexandre Mignucci (français), "Utilisation de l'espace et connectivite à l'interface lagune-mer et inter-lagunes des 3 espèces commerciales côtières majeures de Méditerranée : implication pour la gestion". Encadrants : D. Mckenzie, J. Bourjea. Inscription en thèse le 01/10/2018 à l'Université de Montpellier.

Alaia Morell (française), "Dynamiques éco-évolutives et scénarios de la biodiversité face au changement global en Mer du Nord". Encadrants : Y. Shin, P. Marchal, B. Ernande. Inscription en thèse le 01/10/2018 à l'Université de Lille Nord de France.

Ilan Perez (français), "Entre durabilité de l’exploitation et conservation des écosystèmes hauturiers. Vers un aménagement spatio-temporel de la pêche à la senne du thon tropical dans l’océan Atlantique et dans l’océan Indien". Encadrants : D. Gaertner, L. Guery, M. Authier (ADERA). Inscription en thèse le 01/12/2019 à l'Université de Montpellier.

Teresa Popp (américaine), "Shifts in allele frequencies and their association to fitness and in situ expression in the invasive copepod Eurytemora affinis complex". Encadrante : C. Lorin-Nebel, Lee. Inscription en thèse le 01/09/2020 à l'Université de Montpellier.

Amédée Roy (français), "Intelligence artificielle appliquée à l'écologie des oiseaux marins (sulidés) : Modèlisaation des stratégies de recherche alimentaire dans des écosystèmes tropicaux riches et pauvres". Encadrants : S. Bertrand, R. Fablet (Télécom Bretagne). Inscription en thèse le 01/10/2019 à l'Université de Montpellier.

Julie Salvetat (franco-brésilienne), "Impact de la structuration physico-chimique sur la distribution des poissons pélagiques et démersaux du NE du Brésil évalué par acoustique active multifréquence". Encadrants : N. Bez, A. Bertrand, D. Nerini (Univ de Luminy Marseille). Inscription en thèse le 01/03/2018 à l'Université Federale Rurale de Pernambuco (UFRPE) et l'Université de Montpellier.


Paul Bertrand Sob Nangou (camerounais), "Dynamique de la physicochimie et structure du zooplancton des zones côtières et océaniques du Cameroun (Golfe de Guinée Camerounais)". Encadrants : J.-C. Molinero, S. Zebaze Togouet (Univ. Yaoundé). Inscription en thèse le 01/03/2019 à l'Université de Yaoundé 1 - Cameroun.

Tanguy Soulie (français), "Ecologie du plancton : réponses métaboliques des communautés planctoniques marines aux perturbations : apport des mesures à haute fréquence". Encadrant : B. Mostajir. Inscription en thèse le 26/10/2018 à l'Université de Montpellier.


Ngan Trong Tran (vietnamien), "Salinity impact on catfishes and their aquaculture in the Mekong Delta". Encadrants : J. Panfili, D. H. Hoang, M. Cormier-Salem. Inscription en thèse le 01/02/2016 à l'Université nationale de Hô-Chi-Minh-Ville (VNUHCM).

2021

  • Nina M. D. Schiettekatte, "Fish-mediated functions on coral reefs". Encadrants : Valeriano Parravicini, Sébastien Villéger, Université de Perpignan (UPVD) et CRIOBE.
  • Ramilla V. Assunção, "Thermohaline stratification in the southwestern tropical Atlantic: from physical processes to acoustic ecology". Encadrants : Alex Silva, Anne Lebourges-Dhaussy, Arnaud Bertrand, Université de Bretagne Occidentale (UBO) et Université Fédérale de Pernambuco (UFPE), Brésil.
  • Alina Nathanaël Dossa, "Near-surface Ocean dynamic off northeast Brazil and coastal sea surface salinity gradients in the world ocean". Encadrant : A. Bertrand, Université Fédérale de Pernambuco (UFPE), Recife, Brésil.
  • Ronan Griot (français), "Développement d’outils et de méthodes de sélection génomique chez le bar et la daurade". Encadrants : M. Vandeputte, F. Allal, S. Brard Fudulea, Université AgroParisTech Paris.
  • Leandro Nolé Eduardo ( brésilien), "Lighting up the dark side of the ocean : biodiversity and ecology of deep-sea fishes from the Southwestern Tropical Atlantic". Encadrants : A. Bertrand, F. Lucena Fredou, UM et UFRPE Université Fédérale Rurale de Pernambuco (Brésil) co-tutelle.
  • Géraldine Perez, "Effets du nombre d’objets flottants sur le comportement des thons tropicaux". Encadrants : D. Gaertner, J.-L. Deneubourg, M. Capello, Université de Montpellier.

2020

  • Yannick Baidai, "Dérivation d’un indice direct d’abondance pour les thons tropicaux basé sur leur comportement associatif avec les objets flottants". Encadrants : M. Capello, L. Dagorn, Université de Montpellier.
  • Miriam Brandt, "Metabarcoding in the abyss : uncovering deep-sea biodiversity through environmental DNA". Encadrants : S. Arnaud-Haond, D. Zeppilli, Université de Montpellier.
  • Justine Courboulès, "Effets du réchauffement sur la croissance et la mortalité par prédation des communautés phytoplanctoniques et bactériennes en zone côtière méditerranéenne : approche expérimentale en mésocosmes in situ et étude combinée avec l’acidification". Encadrants : B. Mostajir, Université de Montpellier.
  • Valérie Derolez, "Approche dynamique et intégrée de l’évaluation d’un socio-écosystème côtier. Application à la lagune de Thau, son état écologique et ses bouquets de services écosystémiques sur la période 1970-2018". Directrice de thèse : C. Aliaume (UM), co-encadrants : N. Malet (Ifremer), R. Mongruel (Ifremer), Université de Montpellier.
  • Guillaume Feuilloley, "Analyse de la variabilité spatio-temporelle du zooplancton en Méditerranée nord-occidentale et conséquences sur les populations de petits pélagiques". Encadrants : J.-M. Fromentin, C. Saraux, Université de Montpellier.
  • Fabrice Houngnandan, "Impact des pressions anthropiques et de l’environnement sur les herbiers de posidonia oceanica en Méditerranée française", directrice de thèse : J. Deter (UM), Université de Montpellier.
  • Cyrielle Jac, "Intégrité des habitats benthiques du plateau continental face aux perturbations physiques naturelles et aux arts traînants : quelles méthodes d’observations ? Comment suivre le retour vers le Bon État Écologique ?". Encadrants : S. Vaz, N. Desroy, D. Mouillot, Université de Montpellier.
  • Emna Krichen, "Optimisation et prédiction de la production algale en polycultures : approches expérimentales et modélisation mathématique". Encadrants : E. Fouilland, E. Rapaport (INRA), Université de Montpellier.
  • Virginie Marques, "Nécessité, potentiel et limitations de l’approche en unités taxonomiques moléculaires pour analyser la biodiversité de l’ADN environnemental des poissons", directeur de thèse : D. Mouillot, Université de Montpellier.
  • Guilhem Marre, "Développement de la photogrammétrie et d’analyses d’images pour l’étude et le suivi d’habitats marins", direction  de thèse: J. Deter (UM), S. Luque (INRAe), Université de Montpellier.
  • Charles Rodde, "L’efficacité alimentaire individuelle chez le poisson : méthodes de mesure directe et prédicteurs indirects pour développer des programmes de sélection génétique chez deux espèces aquacoles majeures, le bar européen Dicentrarchus labrax et le tilapia du Nil Oreochromis niloticus". Direction de thèse : B. Chatain, H. de Verdal, Université de Montpellier.
  • Lucie Sidan, "Le droit public face à la « capacité de charge ». L’administration des espaces de la zone côtière". Directrive de thèse : F. Galletti, Université de Perpignan Via Domitia (UPVD).

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