Umr Marbec

DIAGeADN

Diagnostic ADN environnemental des Milieux Marins
Objectifs :

Ce laboratoire commun ambitionne de coupler l’expertise de l’entreprise SPYGEN sur les analyses ADN environnemental (ADNe) et nos compétences en modélisation des indicateurs de biodiversité, pour lever trois verrous méthodologiques avec un système de filtration étanche et stérile pour l’environnement profond, une plateforme de calcul automatisé de 9 indicateurs poissons, et un diagnostic du milieu marin basé sur des algorithmes d’Intelligence Artificielle.

Ces nouveaux outils seront au service des études d’impact en milieux marins, du suivi des actions de restauration (réserves marines ou AMP), et de l’exploration des grands fonds (> 1 000 m), autant de marchés potentiels et de sources d’innovation ou de connaissances.

Project duration : 4,5 ans 2020-2024
International coordination : David Mouillot
Geographical area : 
Funding : ANR LabCom édition 2020
Global budget : 350 000 €
Amount for Marbec : 175 000 €
Marbec coordinator : David Mouillot
Partners :
SPYGEN
The aim of AAPLi is to develop, over a two-year period, 2 or 3 prototype artificial baits based on various materials, technologies and implementation methods that can be deployed in […]
ACTNOW is co-developed with EU policy stakeholders to deliver:1) Mechanistic (cause-and-effect) understanding of the impacts of multiple interacting drivers on organisms, communities, habitats and ecosystems from individual-level performance to ecosystem-level […]
L’intégration des infrastructures « huitre » de l’Ifremer (La Tremblade et Bouin) est donc un enjeu particulier pour faire rayonner encore un peu plus les capacités expérimentales et scientifiques d’excellence […]
Objectives Aquatic or blue foods, including fish, invertebrates, algae, and aquatic plants, are crucial for food and nutritional security worldwide. They provide 15% of global animal proteins and are especially […]
Objectifs Le projet AIME traite les besoins actuels les plus pressants en termes de quantification et de modélisation des changements de la biodiversité. Nous avons constitué une équipe scientifique internationale […]
Objectifs Dans un contexte de changement climatique et de risque accru de crise anoxique, ANOXITO a pour objectif : (1) d’analyser la dynamique de l’oxygène et la variation nycthémérale de […]
AQUAEXCEL2020 intègre les centres de recherche de premier ordre en EU, relevant de tous domaines scientifiques pertinents pour la recherche et l'innovation en aquaculture (génétique, technologie, pathologie, physiologie, nutrition). Il […]
Objectifs L’unité sera impliquée dans cinq tâches : Réponse à la sélection génomique pour l'efficacité alimentaire individuelle ; Interaction Génétique x Nutrition du bar (Ifremer, INRA, ULPGC), un des enjeux […]
Objectifs Les pêcheries palangrières pélagiques capturent nombre d'individus d’espèces non commerciales, non autorisées à être mises à bord et certaines protégées. Le projet ASUR a pour objectif d’améliorer les connaissances […]
ATLASea procédera à la collecte, l’identification taxonomique et la préservation permanente d’échantillons biologiques de chaque espèce. A travers deux projets pilotes, l’exploitation de ces données servira des objectifs dans deux […]
Objectifs La finalité de ce projet est d’améliorer le bien-être des poissons en conditions d’élevage en mettant à disposition des pisciculteurs un outil d’évaluation du bien-être et des éléments sur […]
Natural microalgae and associated bacteria will be selected on organic and metallic toxic compounds. Microalgae-bacteria assemblages will be built, optimized through modeling and tested in large-scale mass culture processes using […]
En synergie avec les projets BiodivMed Occitanie et BiodivMed Corse, le projet BiodivMed Provence Côte d’Azur (PCA) répondra aux 5 objectifs suivants : Échantillonner l’ADNe des habitats côtiers en Provence […]
The main objectives of the BIOMAS proposal are to acquire the necessary knowledge to build an individual-based model of Sargassum growth, to include this model into a drift model, and […]
Objectifs english: Dans le cadre général du cloud européen pour la science ouverte (European open science cloud, EOSC) et de l’économie bleue, le projet H2020 Blue-Cloud renforce la collaboration entre […]
Blue-Cloud 2026 builds upon the pilot Blue-Cloud project which established a pilot cyber platform, providing researchers access to multi-disciplinary datasets from observations, analytical services, and computing facilities essential for blue […]
To achieve this overall goal B-USEFUL will pursue several objectives serving to inform and improve marine management and governance frameworks for biodiversity protection in European Seas within the broader context […]
Les lagunes côtières méditerranéennes sont souvent définies comme des écosystèmes homogènes qui abritent de nombreuses espèces migratrices et sédentaires. Elles abritent pourtant de forts gradients de salinité, des variations de […]
The CIBSEEA project aims to tackle major problems related to the consumption of seafood contaminated by phycotoxins (CTXs), including the Ciguetera disease (CG). Major stake of the project is to […]
OBJECTIFS : Ce projet de recherche cible quatre espèces côtières, la daurade royale (Sparus aurata), le loup (Dicentrarchus labrax), le muge (Mugil spp) et la saupe (Sarpa salpa). Son objectif […]
The lack of knowledge on the conservation benefits of LMMAs for megafauna populations—and dugongs in particular—results from three main limitations that will be addressed by the CONSBEN project:(1) Disproportionate focus […]
On Earth, rearing several edible aquatic organisms with the same water volume into a sustainable Recirculating Aquaculture System (RAS) will contribute to the global food security and the environment conservation/natural […]
Objectifs Ce vaste réseau international rassemble plus de 200 scientifiques et gestionnaires marins, basés dans plus de 45 pays (principalement en Europe, mais aussi en Algérie, au Maroc, en Tunisie, […]
Les prédictions sur le climat futur placent la région méditerranéenne et ses lagunes au cœur de la problématique sociale et environnementale du changement climatique. L’augmentation de la température de l’eau, […]
Le changement global entraîne des épisodes de mortalités massives d’espèces fixées présentes au dessus de la thermocline au sein de l’écosystème coralligène en Méditerranée. Il a été émis l’hypothèse que […]
Le changement global s’accompagne d’épisodes de mortalités massives d’invertébrés fixés sur substrats durs à des profondeurs allant jusqu’à 50 m en régions tropicales comme tempérées. Ce projet s'intéresse à caractériser […]
DEFIPEL vise à consolider la viabilité de la pêcherie des petits poissons pélagiques française en proposant une série d’indicateurs sur l’état de l’écosystème, de la ressource et de la filière, […]
Objectifs Focalisé sur l’amélioration de connaissances-clés sur divers aspects des écosystèmes et des pêcheries démersales d’Afrique de l’Ouest, ce projet de recherche vise à appuyer la production d’avis scientifiques sur […]
Objectifs : Ce laboratoire commun ambitionne de coupler l’expertise de l’entreprise SPYGEN sur les analyses ADN environnemental (ADNe) et nos compétences en modélisation des indicateurs de biodiversité, pour lever trois […]
3 composantes au service du dialogue Science - Décideurs : - Composante A - Des outils pour mettre la connaissance scientifique au service des décideurs - Composante B - Le […]
Objectifs The aim of the project is to limit dolphin mortality caused by pelagic trawler and gillnet fishing in the Bay of Biscay. Based on bio-acoustic and cognitive knowledge of […]
Objectifs L’objectif primordial de cette étude est d’analyser un amalgame complexe de données à fine échelle environnementale, et de pêche à la senne française, en utilisant l’intelligence artificielle pour mieux […]
En France, 39 % des débarquements méditerranéens sont issus de populations évaluées tandis que 61 % des débarquements sont constitués d’espèces dont l’état des populations est méconnu. La méthode d’échantillonnage […]
L’objectif général du projet ECOSYSM-EOF est de proposer une méthodologie et une architecture d’outils d’observation haute fréquence adaptable sur des éléments des Parcs EOF (ex. réseau de câbles, plateforme en […]
Ce projet a profité du confinement au printemps 2020 pour évaluer l’état de référence de la biodiversité en vertébrés marins dans les masses d’eaux côtières de Méditerranée française à partir […]
Il s’agira de communiquer sur : 1) les interactions entre pêcheries et mégafaune marine, 2) la quantification du phénomène de déprédation, 3) les pratiques opérationnelles et innovations visant à réduire […]
Climate change and biodiversity loss are one of the biggest threats facing the world in the next decade. Invasive alienspecies (IAS) are one of the most important direct drivers of […]
Ce projet est porté par la Commission de l’Océan Indien (COI) et vise à lutter contre la pollution plastique marine en soutenant au niveau régional du SO de l’océan indien […]
La vitesse à laquelle se produisent les changements environnementaux constitue le principal défi auquel le vivant devra faire face dans un avenir proche. Les animaux ectothermes (qui ont la même […]
Le projet vise à (i) collecter et combiner des données de plus de 70 campagnes scientifiques de chalutage à travers le monde (métadonnées et abondance d’espèces provenant de plus de […]
Objectifs Ce projet ambitionne de générer des indicateurs écologiques et des modèles prédictifs de la biodiversité des écosystèmes perturbés en combinant des méthodes d'intelligence artificielle aux approches évaluatives connues. Il […]
FlatTrac cherche à tester l'hypothèse d'une évolution parallèle de populations marines aux extrémités de leur aire de répartition en utilisant comme modèle les huîtres plates européennes. Le séquençage de génomes […]
It aims at advancing our current understanding of Sargassum bloom and drift in the open and coastal ocean and help transfer this understanding into a seasonal forecast of the quantity […]
Le projet FORESEA 2050 vise à intégrer les connaissances de plusieurs disciplines à différentes échelles pour envisager la durabilité de la pêche commerciale française à l’horizon 2050 dans le contexte […]
FutureMARES is an EU-funded research project examining the relations between climate change, marine biodiversity and ecosystem services. Our activities are designed around three Nature-based Solutions (NBS): Effective Restoration, Effective Conservation […]
Les bassins côtiers méditerranéens sont riches en biodiversité et soumis à des pressions multiples comme la pollution de l’eau, la compétition avec les espèces exotiques envahissantes, ou encore des évènements […]
L'objectif appliqué est la validation des méthodes de sélection génomique chez le bar (Dicentrarchus labrax) et la daurade (Sparus aurata) pour la résistance à des pathogènes majeurs, VNN pour le […]
Contexte :Depuis plusieurs décennies, les substances adhésives produites par des organismes marins ont fait l’objet d’études. Ces composés présentent des avantages non négligeables par rapport aux composés chimiques de synthèse. […]
Objectifs Les partenaires du projet vont créer et alimenter une infrastructure de données régionale qui permettra aux utilisateurs finaux (scientifiques, gestionnaires, grand public) d’exploiter facilement le patrimoine de données régional […]
Objectifs Acquérir des connaissances fondamentales sur la biologie de l'espadon pour déterminer une meilleure politique de gestion du stock d'espadon de Méditerranée : Identification de la saison de reproduction, des […]
Il s’agit notamment de collecter des données permettant d’améliorer la compréhension de l’écologie spatiale, et d’identifier les habitats (alimentation, hivernage, migration) dans la zone considérée, à l’aide de l’outil télémétrique. […]
L’accroissement de la salinité dans les écosystèmes apparaît comme une conséquence de plus en plus évidente du changement climatique à l’échelle mondiale. Ceci est notamment vérifié dans les zones côtières […]
HYdrologie et PHytoplancton des Lagunes méditerranéennes sous pression du changement climatique Objectifs 1) Bilan des connaissances scientifiques sur le changement climatique régional et analyse des tendances observées sur l’hydrologie et […]
Le projet vise à une meilleure compréhension des liens entre utilisation de l’habitat et exposition aux contaminants chez deux espèces de poissons : l’une pélagique, la sardine, et l’autre benthopélagique, […]
Objectifs Le projet INNOV-FAD a pour objectif principal de développer de nouveaux équipements et de nouvelles pratiques afin de diminuer les impacts des DCP sur les écosystèmes marins : diminution […]
La France n’a pas présenté l’ensemble des indicateurs obligatoires en réponse aux exigences de la Directive Cadre sur l’Eau (DCE). Le groupe ECOSTAT de la Commission Européenne, chargé notamment des […]
Ce projet vise à inventorier les espèces de poissons côtiers par ADN environnemental le long de transects jointifs parallèles à la côte (135 transects jointifs de 5 km x 2 […]
A system of systems strengthening the European network of coastal observatories providing a powerful and structured European Research Infrastructure (RI) dedicated to observe and monitor the complex marine coastal seas […]
Les mers indonésiennes abritent près de 20% des récifs coralliens et 15% des mangroves de la planète, ce qui fait de ce pays une région clé dans la conservation mondiale […]
The IJL TAPIOCA brings together the IRD, the Federal University of Pernambuco (UFPE) and the Federal Rural University of Pernambuco (UFRPE), in association with 10 other Brazilian federal universities. It […]
Objectifs En Europe, l'obligation de débarquement des espèces sous TAC peut devenir bloquante dans le cas de pêcheries mixtes. De plus, l'objectif de Bon État Écologique s'accompagne de mesures de […]
Mediterranean lagoons are currently facing multiple anthropogenic pressures, both regional and global. This is leading to changes in the structure, functioning and services provided by these ecosystems. Understanding the future […]
Objectifs Ce projet de recherche vise à étudier les effets de l’eutrophisationsur la structure et le fonctionnement de la macrofaune benthique en milieulagunaire, en dissociant ces effets de ceux des […]
L’objectif du projet MANFAD est de développer un outil d’aide à la gestion des DCP (e.g. nombre par navire) utilisés par les thoniers senneurs tropicaux afin de proposer des scénarios […]
Le programme MEDITS, campagne scientifique de chalutage de fond,lancé en 1993 sur une incitation de la Commission européenne, a permis d’uniformiser des méthodes d’observation (période, engin, observations...) et de constituer […]
Tâche 1 : Evaluation de la réponse à la sélection (SYSAAF) Pour chacune des couples espèce-pathogène (Tâche 1a bar-nodavirus, 1b bar-vibrio, 1c daurade-pasteurellose), les sélectionneurs adhérents du Sysaaf (Ecloserie Marine […]
Le projet propose d’étudier les conséquences environnementales des mortalités affectant les naissains d’huîtres dans l’étang de Thau depuis 2008, afin d’en comprendre la récurrence. Ces mortalités sont causées par un […]
Développement d’un capteur à microARN pour l’identification du sexe et du stress chez 8 espèces de poissons.L’objectif du projet est de développer une technique de sexage précoce des poissons et […]
Introduced either naturally or intentionally, invasive alien species (IAS) are a main driver of biodiversity loss; they can adapt better to their new environment than natives after a certain time […]
Développer une chaîne d’outils de modélisation permettant d’évaluer l'impact environnemental de fermes marines à terre et en mer, basé sur la prévision de la capacité d'assimilation des rejets biologiques d'un […]
Pelagic ecosystems encompass marine organisms and environmental features located in the open ocean. Figuring among the largest ecosystems on Earth, they are increasingly recognized for their important role in supporting […]
We will address three main challenges: 1) The inventory of potential pathogenic bacteria (PPB) and antibiotic resistance gene (ARG) that occur in marine habitats and their reservoirs are poorly documented, […]
Ce projet s'attache à (1) rechercher des descripteurs fins des habitats lagunaires (structuration 3D, potentiel trophique…), (2) évaluer la fréquentation des juvéniles de poissons au sein de ces habitats, (3) […]
Les organismes aquatiques constituent de précieuses sources de nutriments pour l’alimentation humaine. Alors que les pêches mondiales sont restées relativement stables au cours des dernières décennies, la production aquacole mondiale […]
La capacité des récifs coralliens à subvenir aux besoins d'environ un milliard de personnes diminue en raison d'un grand nombre de pressions liées aux activités humaines. Leur durabilité à long […]
Objectifs Fournir une feuille de route opérationnelle pour une intercalibration robuste des suivis aériens de la mégafaune marine dans les parcs EMR en utilisant différentes technologies, améliorer l’efficacité de la […]
PADI entend documenter un certain nombre d’interrogations liées à la pollution plastique des milieux lagunaires et littoraux ivoiriens. PADI est portée par le Prof. Allassane OUATTARA de l’Université Nangui Abrogoua […]
L’objectif de PARADEP est de développer et d’industrialiser un dispositif de protection physique du poisson à l’intention de la pêcherie palangrière pélagique ciblant le thon et l’espadon, et régulièrement impactée […]
Les traits morphologiques sont-ils représentatifs des traits des poissons (ex. métabolisme,préférence thermique) ? Les stratégie de conservation sont-elles efficaces si elles se concentrent sur quelques traits intégratifs (ex. l'alimentation, la […]
Objectifs Jeux de données déjà acquis : un jeu de données "Truite", incluant des spectres obtenus par spectroscopie RAMAN (projet FEAMP OmegaTRUITE) avec des génotypes profonds (puce Axiom 57k Truite) […]
Objectifs Il est vital d'identifier de nouveaux médicaments pour faire face aux agents pathogènes résistant aux antibiotiques actuels. Il est suggéré que la culture intensive de microalgues marines sous forme […]
L'objectif principal du projet PHYCOCYP est d'améliorer la compréhension des processus de biotransformation et leur rôle dans la tolérance du phytoplancton aux contaminants organiques (OCs). Parmi les nombreuses enzymes impliquées […]
Coordinated by the Tara Ocean Foundation, Plankt'Eco aims to meet the need for knowledge about planktonic ecosystems and their integration into fisheries and climate work. It is a programme for […]
Objectifs (i) d’évaluer de manière expérimentale, le transfert des pathogènes humains, et leur antibiorésistance, associés aux plastiques marins vers les poissons récifaux pêchés à Tuléar, (ii) d’évaluer la persistance des […]
Les objectifs principaux du projet sont : (i) Renforcer les données d’observations à la mer (observateur embarqué) afin de d’améliorer le taux de couverture très faible de la pêcherie dans […]
Coral reefs are in precipitous decline worldwide due to a number of global stressors and local human impacts. Nutrient pollution emanating from sewage outfalls and coastal runoffs is often associated […]
L'objectif est de produire des indicateurs d’évaluation d’abondance des stocks de poissons, complémentaires des approches classiques utilisant les statistiques de prises et d’effort des pêcheries. Face aux incertitudes liées à […]
Comment avancer sur la compréhension des dynamiques migratoires du thon rouge dans le contexte de changement climatique actuel ? Comment identifier et hiérarchiser les processus potentiels impliqués dans les migrations […]
The diagnosis and integration of bycatch data across all industrial European fleets in the region, linked with fishing effort and the spatiotemporal distribution of the species, will provide a systematic […]
L’augmentation globale de la température entraine des modifications de la salinité des océans. Ces changements excèderont les limites physiologiques de nombreuses espèces dont les réponses évolutives seront critiques pour éviter […]
Le projet RETROSCOPE vise à étudier les trajectoires de 3 socio-écosystèmes côtiers à vocation conchylicole (Baie des Veys, Pertuis Charentais, lagune de Thau) sur la période 1970-2018, en adoptant une […]
Modeling and forecasting Sargassum strandings in the tropical Atlantic Ocean is essential for designing effective integrated risk management strategies in link with environmental, economic, health, regulatory and decision-making policies. The […]
Déroulé du projet : L'Ecloserie Marine de Graveline (EMG) enverra 2000 poissons (bar) de 5g issus des candidats à la sélection à l’Ifremer de Palavas. 800 de ces poissons seront […]
Objectifs Démontrer la pertinence des solutions logicielles de traitement et d’analyse des photographies aériennes pour assurer le recensement automatisé de la mégafaune marine.
Objectifs Construire la base de données la plus complète à ce jour sur les méduses en mer Méditerranée à partir de données provenant de diverses sources (réseaux sociaux, médias de […]
It addresses the role of eco-evolutionary dynamics and their consequences for the sustainable exploitation of fish resources in the future. The key open question addressed is whether exploited fish populations […]
Au sein de l’UMR MARBEC, les plateformes PEMP de Palavas-les-Flots (Station Ifremer) et EXAAQT de Montpellier (Université de Montpellier, Campus Triolet) sont des établissements hébergeurs et utilisateurs d’animaux à des […]
Un événement d’entrée d’eau de mer dans le lac est une opportunité unique et inattendue de comprendre comment les communautés microbiennes réagissent face à des changements drastiques du milieu. Trois […]
Objectifs La Jeune Équipe Associée à l'IRD (JEAI) TABASCO est axée sur le renforcement de la recherche sur l'écologie des oiseaux marins tropicaux au Brésil. D'un point de vue scientifique, […]
Natural floating objects, like tree debris (logs), constitute an essential component of the marine pelagic habitat. Extreme weather events and changes in tree coverage induced by global change can have […]
TRIATLAS contributes to this by delivering knowledge of the current state and future changes of the Atlantic marine ecosystems. We achieve this goal through a basin-wide approach that integrates research […]
À l'échelle mondiale, le réchauffement rapide de la surface de la mer a été associé à une forte augmentation du nombre et de l’intensité des vagues de chaleurs (MHWs). Être […]
Objectifs 1-Evaluer la variabilité des pathogènes humains et de leur antiorésistance associés aux plastiques ; 2-Déterminer leur transfert chez les organismes qui ingèrent des plastiques ; 3-Evaluer leur persistance en […]
Objectifs Le barcoding est un outil de choix dans de nombreux contextes nécessitant l’identification précise des espèces. Ces barcodes ADN ont vu leur intérêt encore accru avec l’analyse de l’ADN […]
Objectifs En tant qu'organismes ectothermes, les poissons sont particulièrement sensibles à tout changement de température qui modifierait l'activité enzymatique et le métabolisme. Par conséquent, le réchauffement climatique devrait avoir un […]
BoucleDor a pour but d’acquérir les connaissances encore manquantes sur l’écologie de la dorade royale en Languedoc-Roussillon. Pour cela, nous combinerons de façon inédite des techniques de pointe en génétique […]
Objectifs Objectif général : “Bioremédiation des rejets de poissons par des organismes assemblés en aquaculture intégrée multi-trophique.” Postulat de départ : les détritivores et les autotrophes incorporés aux AIMT améliorent […]
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