REMI
Réseau de contrôle microbiologique des zones de production conchylicoles.
Surveillance sanitaire microbiologique des zones de production de coquillages classées par arrêté du préfet du département
DESCRIPTION :
1989 - En cours
Sur la base du dénombrement dans les coquillages vivants des Escherichia coli (E. coli, bactéries communes du système digestif, recherchées comme indicateur de contamination fécale), le REMI a pour objectifs :
- d’estimer la qualité microbiologique des zones de production de coquillages,
- de suivre l'évolution des niveaux de qualité microbiologique des zones de production de coquillages,
- de détecter et suivre les épisodes inhabituels de contamination.
Maître d'œuvre : Ophélie Serais.
Maître d'œuvre au niveau Départemental : préfet.
En Occitanie :
- les préfets ont confié la mise en œuvre du REPHYTOX au Département de l'Hérault,
- la Direction Départementale de la Protection des Populations de l'Hérault (DPP34) coordonne le dispositif pour l’ensemble des départements de la région Occitanie,
- le Laboratoire Environnement Ressources du Languedoc-Roussillon (LER/LR) de l'Ifremer assure une AMOA (stratégie d'échantillonnage, accompagnement des opérateurs chargés des prélèvements et analyses, gestion des données et leur diffusion),
- le Laboratoire Départemental Vétérinaire de l'Hérault (LDV34) intervient sur les prélèvements et analyses.
Maîtrise d’ouvrage : Direction Générale de l'Alimentation (DGAL).
Ifremer : appui scientifique et technique à la DGAL ainsi qu'aux services déconcentrés de l'Etat (DDi) relatif à la mise en œuvre du dispositif - Assistance à Maîtrise d'Ouvrage (AMOA).
Partenaires : En Occitanie :
- société P2A Développement: prestataire du LDV34 pour la réalisation des prélèvements de coquillages.
- Laboratoire Départemental d'Analyses des Bouches du Rhône (LDA13): prestataire du LDV34 pour la réalisation des analyses.
Financement : Direction Générale de l'Alimentation (DGAL) / Budget annuel : budget annuel Ifremer pour la région Occitanie.
Ambitions concernées : ambition 5 (promouvoir une pêche et une aquaculture marine durables).
Dispositifs concernés : DOS (Dispositif d'Observation in situ).
Accès données :
Responsable : Ifremer (données bancarisées dans Quadrige2).
Site web : https://wwz.ifremer.fr/envlit/Surveillance-du-littoral/Microbiologie-sanitaire/
Accès aux données : Surval (http://www.ifremer.fr/surval2/)
Base de données : https://www.seanoe.org/data/00360/47157/
DOI : 10.17882/47157
INTÉRÊT SCIENTIFIQUE :
Problématique scientifique : le milieu littoral est soumis à de nombreuses sources de contaminations microbiologiques fécales d’origine animale et humaine. C’est ainsi que l’on retrouve dans les eaux littorales une multitude de microorganismes potentiellement pathogènes pour l’homme (bactéries, virus, protozoaires) qui se retrouvent filtrés et concentrés par les coquillages. Aussi, la présence dans les eaux de bactéries ou de virus potentiellement pathogènes pour l’homme (Salmonella spp., Vibrio, norovirus, virus de l’hépatite A) peut constituer un risque sanitaire lors de la consommation de coquillages (gastro-entérites, hépatites virales).
Coordinateur scientifique de l'ensemble du réseau : Jean-Côme Piquet (Ifremer, Nantes).
Coordinateurs scientifiques MARBEC : Ophélie Serais, Camille Gianaroli.
Emprise géographique : littoral français. En Occitanie, littoral et lagunes.
Date et fréquence d’acquisition : surveillance mensuelle à bimestrielle selon les points.
Alerte : dans les 48H après déclenchement, puis hebdomadaire.
Mots clés : réseau, observation, surveillance, littoral, phytoplancton, paramètres hydrologiques.
Paramètres suivis : Escherichia coli.
Métrologie : les analyses sont réalisées uniquement dans des laboratoires agréés par le ministère de l’Agriculture et de l’Alimentation pour le dénombrement des Escherichia coli dans les coquillages marins vivants. La méthode d’analyse utilisée est la méthode de référence ou toute autre méthode reconnue officiellement par la Commission Européenne comme méthode alternative à la méthode de référence. Dans les laboratoires agréés, tous les équipements susceptibles d'impacter directement ou indirectement la qualité des résultats sont étalonnés (raccordement aux étalons de référence). Le suivi métrologique est tracé.
Labellisation / Certification : pour la partie AMOA assurée par l'Ifremer : certification ISO 9001. Toutes les opérations, du prélèvement à la bancarisation des données, sont effectuées sous démarche qualité, dont les principales composantes sont :
- l'agrément par le Bureau de l'évaluation scientifique, de la recherche et des laboratoires (BERL) de la DGAL des laboratoires accrédités par le cofrac pour les prélèvements et analyses,
- un document de prescription national,
- un pilotage des méthodes d'analyses de recherche et dénombrement des E. coli dans les coquillages marins vivants par le LNR Microbiologie des Coquillages de l'Ifremer.
Autres observatoires
Communautés planctoniques de la lagune de Thau
Service d'observation des communautés planctoniques de la lagune de Thau de l'OSU OREME
L'objectif est de suivre à long terme l’évolution des communautés planctoniques dans la lagune de Thau pour mettre en évidence les changements de biodiversité et d'abondance.
Campagne de pêche scientifique sur les espèces démersales (Méditerranée et Mer Noire).
Dans le cadre de l’Approche écosystémique des pêches, l’Ob7 a mis en œuvre un système d’information pour la gestion et l’analyse des données, avec des collaborations scientifiques au Nord et […]
SIH-Ressources-Campagnes à la mer. Campagne d’évaluation acoustique et de pêche d’identification avec pour but principal l’évaluation des stocks de petits pélagiques (anchois, sardines).
Réseau de 104 plateformes sur le domaine côtier d’une vingtaine de territoires et états insulaires à l’échelle du Pacifique Sud, Sud-Ouest et Ouest.
Réseau qui vise à fédérer et coordonner à l’échelle du littoral français un ensemble de plateformes fixes instrumentées de mesures in situ hautes fréquences pour des paramètres clés des eaux […]
Mesure périodique de la taille des individus des principales espèces en criée et aux points de débarquement, en tenant compte des appellations commerciales pratiquées sur les lieux de vente.
Obtenir des informations sur les paramètres biologiques des principales espèces évaluées
Le Système National d’Observation (SNO) PHYTOBS est un réseau national de 25 sites d'observation du phytoplancton sur les côtes françaises (méthode de comptage par microscopie aux fréquences bi-mensuelle ou mensuelle).
Surveillance sanitaire microbiologique des zones de production de coquillages classées par arrêté du préfet du département
REPHY
Réseau d’Observation et de Surveillance du Phytoplancton et de l’Hydrologie dans les eaux littorales.
Connaissance de la biomasse, de l’abondance et de la composition du phytoplancton marin des eaux côtières et lagunaires, ainsi que du contexte hydrologique afférent.
Recherche et suivi des toxines susceptibles de s’accumuler dans les mollusques bivalves des zones conchylicoles classées par l’Administration et exploitées par les professionnels
Répondre aux obligations nationales, communautaires et internationales de surveillance chimique.
Etudier les dynamiques spatio-temporelles des communautés de virus, bactéries et micro-algues et les espèces toxiques et pathogènes potentiellement émergentes de l’écosystème marin côtier français.
SELAMAT observatory
The Indonesian national observation network for fieldwork and monitoring of sentinel species and ecosystems
Examiner les changements des systèmes côtiers sur le long terme, et quantification des influences de la variabilité climatique.
Mieux comprendre la connectivité de quatre espèces côtières, la daurade royale, le loup, le muge et la saupe
Diagnostic de l’état écologique et chimique des lagunes méditerranéennes poly- et eu-halines (salinité moyenne >18 PSU).
L'objectif est de déterminer et suivre l’état écologique des nourriceries côtières des fonds meubles du golfe du Lion.
Compréhension des processus de restauration ou de dégradation lagunaire, et pour avoir une vision plus exhaustive du "risque pesticides" en lagune.
Expertise halieutique, évaluation de stock de thon rouge.
L’objectif du SO REC-THAU est de suivre l’évolution sur le long terme (i) des apports de bassin versant à la lagune de Thau.
Archivage des données acquises par les les-observatoires et/ou programmes de recherche.
Acquisition de paramètres météo pour la modélisation ou la recherche.
Suivre l’évolution sur le long terme (i) des apports de bassin versant à la lagune de Thau.