Une équipe internationale impliquant des chercheurs de l’École Pratique des Hautes Études - PSL (EPHE-PSL), de l’Université de Montpellier, de l’IRD, de l’Ifremer, du CNRS, et de l’École polytechnique de Zurich a parcouru les océans tropicaux durant deux ans au cours de plusieurs expéditions afin de filtrer et séquencer l’ADN environnemental (ADNe) laissé par les poissons dans l’eau. Ils ont détecté une diversité en poissons récifaux plus élevée de 16 % que celle obtenue avec les techniques conventionnelles d’observation visuelle avec un effort d’échantillonnage bien plus important sur 13 ans. Cet article a été publié dans la revue Proceedings of the Royal Society B le 20 avril 2022.
La distribution spatiale et les mécanismes à l’origine de la diversité des poissons coralliens restent mal connus car les données d’occurrences sont parcellaires ou manquantes pour de nombreuses espèces. Les récifs coralliens hébergent la plus grande diversité en poissons marins alors qu’ils ne couvrent que 0,1 % de la surface des océans. Cette diversité, fortement menacée par les perturbations climatiques et humaines, est estimée à ce jour entre 2 400 et 8 000 espèces réparties dans environ 100 familles. Elle est maximale dans le triangle de corail du Pacifique, avec en particulier des espèces herbivores dont les brouteurs de corail. Des variations dans la composition en espèces apparaissent en raison d’isolements géographiques. Finalement, la moitié de la diversité en poissons récifaux est constituée par de petites espèces benthiques, qui vivent proche du fond, très difficiles à observer avec des approches classiques comme les comptages visuels.
Mathon, L., Marques, V., Mouillot, D., Albouy, C., Andrello, M., Baletaud, F., Borrero-Pérez, G.H., Dejean, T., Edgar, G.J., Grondin, J., Guerin, P.-E., Hocdé, R., Juhel, J.-B., Kadarusman, null, Maire, E., Mariani, G., McLean, M., Polanco F., A., Pouyaud, L., Stuart-Smith, R.D., Sugeha, H.Y., Valentini, A., Vigliola, L., Vimono, I.B., Pellissier, L., Manel, S., 2022. Cross-ocean patterns and processes in fish biodiversity on coral reefs through the lens of eDNA metabarcoding. Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences 289, 20220162. https://doi.org/10.1098/rspb.2022.0162
Contacts chercheurs :
EPHE-PSL : Stéphanie Manel
MARBEC : David Mouillot, Régis Hocdé
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