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  • Amandine Avouac

Prénom :
Amandine
Nom :
Avouac
E-mail :
amandine.avouac@umontpellier.fr
Organisme :
UNIVERSITÉ DE MONTPELLIER
Grade / Titre :
Assistante ingénieur terrain et métadonnées au sein du LabCom Diag-ADNe « Diagnostic ADN Environnemental des Milieux Marins »
Ambitions :
Dresser l’état des lieux de la biodiversité marine, Evaluer les causes de la perte de la biodiversité marine, Proposer des outils de conservation de la biodiversité marine et anticiper les risques émergents
Projets :
DIAGeADN, BiodivMed PCA
Disciplines :
Biologie des organismes, Biologie moléculaire
Modèles biologiques :
Poissons côtiers et récifaux, Mammifères marins
Ecosystèmes :
Ecosystèmes côtiers et littoraux
Zones d'études :
Méditerranée, Golfe du Lion, Océan Atlantique
Biographie :

Ma mission principale est de venir en appui en tant que cheffe de mission au LabCom Diag-ADNe « Diagnostic ADN Environnemental des Milieux Marins » dans l'organisation et la participation des missions sur le terrain utilisant les méthodes basées sur la filtration et l'analyse de l’ADNe.


Projets de recherche principaux :
• BiodivMed 2023 - réaliser grâce à l’ADNe une cartographie inédite et un inventaire du vivant synchronisé et standardisé sur le littoral méditerranéen français et le sanctuaire Pelagos.


• Aires Marines Sentinelles (AMS) - structurer un réseau de surveillance pérenne, notamment autour des Aires Marines Protégées, afin de renforcer les politiques de conservation pour ces écosystèmes vulnérables. Terrain notamment au sein du parc éolien de Saint-Nazaire, du Parc Naturel Marin du Golfe du Lion et de la Réserve Naturelle Marine de Cerbère-Banyuls.


• Grand Dauphinmettre au point une méthode d’échantillonnage non-invasive et standardisée afin de développer, par la suite, des marqueurs nucléaires à l’échelle populationnelle pour en savoir plus sur la génétique des populations de grands dauphins (Tursiops truncatus). L’objectif étant d’acquérir, à terme, des informations sur la structure, la diversité génétique, la taille et la connectivité́ des populations de T. truncatus de France métropolitaine, permettant ainsi de mieux comprendre la dynamique de l’espèce pour mieux la protéger.

Enseignement :

Compétences et responsabilités en tant que :


-       cheffe de mission de part la gestion des équipes et du matériel (préparation, entretien et gestion du matériel, organisation, coordination et optimisation de la formation des agents, stagiaires, doctorants, partenaires) ;


-       gestion de projets, formation et communication (gestion des échantillonnages au sein du parc éolien de Saint-Nazaire et alentours, prises de contacts spontanées et maintien de liens avec des partenaires, prestataires, fournisseurs, demande d’autorisations de Recherche Scientifique Marine (RSM) auprès de la Préfecture Maritime de l’Atlantique) ; 


-       travail de terrain (missions d’échantillonnages en France, à terre et en mer, sous climat froid ou chaud, de jour et de nuit, travail week-ends et/ou jours fériés, filtrations d’ADN environnemental (ADNe)) ;


-       gestion et traçabilité des échantillons, commandes ;


-       centralisation, uniformisation et mise en forme de métadonnées ;


-       compétences de laboratoire en biologie moléculaire (extractions ADN, PCR et qPCR, électrophorèse), microbiologie et qualité (cultures et isolements bactéries et micro-algues, suivis de croissance, antibiogrammes, manipulation de micro-organismes hautement pathogènes, travail sous assurance qualité), et étude du modèle poisson (capture, dissections, mesures morphométriques, expérimentations en mésocosmes). 

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