> Par Jean-Christophe AUGUET, Chercheur CNRS, UMR MARBEC
Les milieux marins contiennent des milliards et des milliards de micro-organismes jouant un rôle crucial dans le fonctionnement des écosystèmes. Facilitées par les récents progrès en biologie moléculaire permettant d’inventorier et de décrire les micro-organismes à grande échelle, les recherches au cours des 30 dernières années ont démontré l’exceptionnelle diversité de ces micro-organismes composant le plancton marin, c’est à dire vivant dans la colonne d’eau. Les microorganismes associés aux macroorganismes marins ont, quant à eux, connu un intérêt plus tardif. C’est par exemple le cas de ceux associés aux poissons ou aux coraux. Ces communautés microbiennes, appelées « microbiotes », car vivant en interaction avec un hôte animal, joueraient des rôles importants pour la santé de leurs hôtes mais également celle de l'environnement. Ma recherche consiste donc à étudier la dynamique, les espèces qui composent ces microbiotes et leurs rôles que ce soit pour leurs hôtes ou pour l’environnement.
Mots clés : microbiotes, océan, récifs coralliens, ADN environnemental.
