Umr Marbec

stage M2 2024-2025 - « Les microARNs comme régulateurs des gènes du stress thermique chez le poisson »

Sujet
Ce projet de recherche vise à mieux comprendre la réponse physiologique du bar commun Dicentrarchus labrax à l’augmentation de la température. Il vient compléter les travaux en cours, construit autour d’une Thèse, dans le cadre du projet STREEESS (financé par EDF sur la période 2023-2026) en y ajoutant une brique fonctionnelle sur les réponses épigénétiques du bar commun à l’augmentation de la température lors d’évènements extrêmes.

Plus précisément, le but principal de ce projet de stage est d’identifier des microRNAs (régulateurs épigénétiques) impliqués dans la réponse à l’augmentation de la température et à l’hypoxie. Il s’agira d’analyser l’expression des miRNAs et des potentielles cibles liées au stress (mRNAs : ex gr1, gr2, mr et crf) en qPCR à partir de différents organes (hypothalamus, hypophyse et Interrenale) prélevés en 2023 suite à l’exposition à 10 jours d’évènements extrêmes (9 individus Contrôles/9 Hyperthermie/ 9 Hypoxie /9 Hyperthermie + hypoxie).

En outre, l’étudiant sera aussi impliqué dans des expériences sur la reproduction et le comportement du bar, menées dans le cadre de la thèse. Les individus seront testés pour leur préférendum thermique en utilisant des systèmes basés sur la préférence de place dans des aquariums à multi-compartiment avec un gradient de température. Le déterminisme du sexe du bar étant lié à la température, nous explorerons la diversité inter-individuelle de préférendum thermique, pour évaluer si les individus qui choisissent les zones chaudes deviennent par la suite des mâles et ceux qui choisissent les zones froides deviennent par la suite des femelles à 50 dpf et l’inverse à 80 dpf. L’étudiant pourra participer à ces expériences, mais également au suivi des élevages de bars.

Pour répondre à ses objectifs, l’étudiant(e) sera amené(e) à utiliser des techniques d’extraction ARN, de RT-PCR, de qPCR et d’analyse du comportement.

Lieu et Durée du stage
5 mois compris dans le créneau de janvier à Juin 2025.
Site Triolet majoritairement, station Palavas.

Encadrants
Benjamin Geffroy, Benjamin(point)Geffroy(arobase)ifremer(point)fr

Elisa Sniecinski,  Elisa(point)Sniecinski(arobase)ifremer(point)fr

Marie-laure Bégout,  marie(point)laure(point)begout(arobase)ifremer(point)fr

Candidature
Le CV et la lettre de motivation doivent être envoyés par email aux adresses de contact.
L’évaluation des dossiers se fera au fil de l’eau jusqu’à ce que le stage soit pourvu.

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